“借此，中国金融正在实现弯道超车，功能效率大幅提升，但这也给监管带来困惑。”他说，在这种背景下，中国的监管也需要，并正在发生重大变化。当前，我国金融监管要着重考虑下述三方面问题：
一是要从单一监管机构风险，转变为更好地管理市场风险，因此需要改革金融架构，银保监会加强机构监管，证监会加强对市场监管。
二是要对什么是证券市场进行更深入的理解，他认为所有证券化的金融资产都应该纳入市场监管体系，并对监管重点予以区分。
三是要深度理解什么是金融监管。吴晓求说，加强金融监管可以让风险衰减，降低传导和“感染”的几率。但金融监管不能消灭风险，而是要防止个别风险变成系统性风险，防止系统性风险发展为金融危机。同时，监管不能扼杀创新，而应推动创新。
吴晓求还对此次机构改革后“一行两会”架构下金融监管的职责分工谈了自己的看法。他认为，现行机构设置下，央行主要负责宏观审慎管理，制定制度规则，保持金融体系的整体稳定；两会相互协调，负责对微观行为、机构及市场风险的管理，重点监管市场风险和市场行为。此外，在特殊时期，如遇重大危机，金稳委将起到重大事项协调的作用。
“在现行金融监管框架下，将规则指标设置好，相互之间有比较严密的逻辑关系，要防范系统性金融风险还是非常有信心的。”他说。
